Если рассматривать домены в масштабах мира, то домен COM выигрывает, и оптимален для компаний, желающих охватить земной шар. Но такие широкие перспективы не всегда оправданы, и, если Вы нацелены только на Российскую аудиторию и страны бывшего СНГ, спокойно выбирайте RU. Национальный домен почти на десять лет младше, но созданный в 1994 году, сейчас не менее популярен, чем COM.
В продвижении особой разницы не будет, как и в доверии пользователей. Трудности могут возникнуть с выбором лаконичного, не занятого имени. К примеру, трехбуквенные имена на .COM закончились более 20 лет назад, варианты из четырех букв тоже не доступны к регистрации. Это не значит, что приобрести такой домен нельзя. Купить трех или четырехбуквенный домен можно у перекупщиков и цена будет в разы выше.